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    實(shí)時(shí)熒光定量PCR的優(yōu)化(二)

    發(fā)布時(shí)間: 2021-10-12  點(diǎn)擊次數(shù): 1193次

    如果你所研究的靶序列有前人建立過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR的方法,就可以在公共數(shù)據(jù)庫(kù)中查找,查看擴(kuò)增效率、特異性、靈敏度等信息,省去從頭開(kāi)始的時(shí)間。


    注意,使用前人建立的方法前,需要再次驗(yàn)證這個(gè)方法的參數(shù)是不是符合描述。防止長(zhǎng)時(shí)間重復(fù)實(shí)驗(yàn),卻得不到想要的結(jié)果的人間慘劇。


    推薦的公共引物探針數(shù)據(jù)庫(kù):


    1、RTPrimerDB


    這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)的約6000個(gè)基因,來(lái)自人、擬南芥、大鼠等21個(gè)物種,相對(duì)其他數(shù)據(jù)庫(kù)豐富。這些引物和探針,也是經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的,70%已發(fā)表。使用該數(shù)據(jù)庫(kù)時(shí)建議通過(guò)網(wǎng)絡(luò)代理登錄。


    2、PrimerBank 


    這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)的探針引物是通過(guò)算法設(shè)計(jì)得到的,主要包括人和小鼠的基因。數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)的小鼠引物,經(jīng)過(guò)廣泛驗(yàn)證后,被證實(shí)有83%的成功率。


    3、Real Time PCR Primer Sets 


    這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)內(nèi)的引物和探針都經(jīng)過(guò)測(cè)試、優(yōu)化,針對(duì)多種生物設(shè)計(jì),包括人、小鼠、大鼠等的基因。


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